MALDI-TOF MS（Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry，基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱）是基于微生物核糖体等高丰度稳定表达的特征蛋白指纹图谱的快速鉴定技术。通过MALDI-TOF MS分析获得微生物菌种核糖体蛋白指纹图谱，与已知微生物菌种蛋白指纹图谱数据库比对分析后，实现微生物菌种的快速鉴定。

MALDI-TOF MS数据库中菌株种类丰富，来源广泛，主菌种库中含有细菌、酵母菌和丝状真菌3893个种，10833株菌株，丝状真菌库中包含274个种，856株菌株，其中包括了芽胞杆菌属、双歧杆菌属、酵母菌、霉菌等常见工业微生物。MALDI-TOF MS在微生物鉴定方面具有速度快，灵敏度高，准确度高的特点，从待测菌株平皿培养物到最终得到鉴定报告，96个样品所用时间小于1h。

作为新兴的微生物快速鉴定方法，MALDI-TOF MS快速鉴定技术是目前国内外的研究热点。国家标准委发布了《基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴别微生物方法通则》（GB/T 33682-2017）标准文本，并于2017年12月1日实施，美国临床和实验室标准协会（CLSI）发布了《Methods for the Identification of Cultured Microorganisms Using Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry》。MALDI-TOF MS已成为微生物菌种鉴定的标准方法。

中国工业微生物菌种保藏管理中心（CICC）作为国内最大规模的微生物菌种保藏管理、鉴定评价和进口的专业机构，长期从事微生物菌种鉴定与评价工作，拥有国内第一台MALDI-TOF MS（smart）设备。该型号设备与MALDI-TOF MS（Microflex）相比，光源更稳定，运行速度更快。目前CICC MALDI-TOF MS微生物快速鉴定方法已通过CNAS认证，并面向广大食品、药品、化妆品等工业企业、检测机构、高校及科研单位提供服务。